KAPA变容二极管的

KAPA变容二极管的工作流程

概述

由于新一代测序(NGS)样品制备需要多个步骤,每一个步骤都对整个测序的成功和效率至关重要,所有步骤都需要在试剂和协议方面进行优化。考虑到NGS样品的珍贵性质,为了将样品转化为可测序的文库,有必要使用优化的试剂集成工作流。NGS样本类型可以在以下方面有所不同:

  • 方便测序-均匀或有次生结构或富含gc的区域
  • 质量新鲜提取或保存(福尔马林固定石蜡包埋(FFPE))
  • 卷可用-合理的数量到非常小的样本量


考虑到所有这些变化,使用可以与所有这些样品类型一起工作的文库制备试剂是很重要的。高质量的文库制备试剂有助于获得统一和提高覆盖率,并降低重复率。根据最终目标(例如,整个外显子组测序),可能还需要一个目标富集步骤来富集特定的感兴趣区域。使用高效的目标富集试剂有助于获得均匀和高深度的覆盖。

最新版本的KAPA HyperCap工作流结合了KAPA文库制备和KAPA HyperCap目标富集探针和样品制备所需的所有附件和试剂的验证产品到一个单一的工作流。新KAPA HyperCap靶富集探针提供高捕获效率,测序均匀性和低重复,并与更新KAPA HyperPlus包,工作流提供了更好的目标覆盖率和更高的变量检测置信度。此外,工作流还包括KAPA通用适配器,KAPA通用UMI适配器和KAPA UDI底漆混合(最高可达384).KAPA HyperCap工作流利用了著名的探针设计和选择算法,提供了方便的简化订购和单一供应商的支持,是自动化友好的。使用KAPA HyperCap工作流生成的测序数据可以通过罗氏基于云的二级分析解决方案-进行分析NAVIFY®突变调用者-用于精确检测种系SNV和indel变异。

KAPA HyperCap工作流的特点和好处

  • 使用创新的适配器和UDI引物混合,提高了库转换效率,降低了索引错误分配
  • 通过新的末端修复、a尾化学和单面后结扎尺寸选择,增强了测序性能和更快的工作流程
  • 使用KAPA HiFi聚合酶制造的高保真度探针增加了捕获均匀性和测序效率
  • 通过基于nggs的QC确认探针的存在和预期浓度
  • 方便的全包括的工作流程与验证的产品和简化订购和支持从单一的供应商
  • 自信的种系SNV/Indel呼叫NAVIFY®突变调用者

集成和精简的工作流程

  • 以较低的投入,提高编库效率
  • 较高的覆盖率和较低的重复率
  • Automation-friendly
  • 从单个供应商订购和支持工作流的所有产品
  • 珠基杂交设置,单温度杂交洗涤,包括UEO,不需要SpeedVac

通用增强Oligos (UEOs)允许简单的实验计划

  • 减少了时间和复杂性,消除了适配器匹配的阻塞oligo使用
  • 灵活地阻止6和8基条形码适配器,并与单索引或双索引策略一起使用

使用KAPA HyperPlex适配器高效构建库

  • 最低水平的适配器二聚体形成
  • 条形码交叉污染的名义水平由基于测序的QC测试确认
  • 与现有选项相比,具有更高的多路性
  • 更高的库转化率
  • 精确的分子计数和PCR/测序误差修正KAPA通用UMI适配器

易于自动化的工作流,具有广泛的平台兼容性

  • 减少了对仪表的要求,使自动化变得容易
  • 多路复用,优化机器人利用率
  • 以协调性能为手工方法