有针对性的测序

将您的测序工作集中在感兴趣的基因组区域

靶向测序为基因组中感兴趣的特定区域提供了独特的见解。它是一个强大的应用程序，用于研究各种疾病领域，如肿瘤学，遗传性疾病，免疫学和传染病。该应用程序允许精确和高效地定位特定基因，编码区域，甚至染色体片段。

靶向测序比全基因组测序更具成本效益。与WGS和其他调查方法相比，它还可以对结果进行更深入的分析。此外，它允许更深入的测序，覆盖的深度有助于避免对测序数据的错误解释。由于这种敏感性，靶向测序在癌症研究中的变异呼叫、疾病相关突变的识别、单基因疾病和基因表达研究中提供了巨大的优势。对特定区域的靶向测序还可以发现罕见疾病的致病基因。靶向测序的重点方法提供了其在靶向治疗应用和个性化医疗工作中的使用可能性。例如，多态人类白细胞抗原(HLA)基因的定向重测序有助于HLA分型，这对于造血干细胞或实体器官移植的匹配至关重要。

定向测序的好处

允许检测和量化罕见和低频变异
能够实现更高的覆盖率，更深入的测序和直接的数据分析
提供成本效益，节省时间和资源，以及精度
为后续的生物信息学分析提供更易于管理的数据集
可以分析比全基因组测序更多的样本

靶向测序是如何工作的?

靶向测序的样品制备工作流程需要一个额外的目标富集步骤。它使用用户定义的探针集来丰富感兴趣的特定基因组区域，从而只对该区域进行测序。目标富集的两种方法是基于杂交和扩增。基于杂交的方法使用探针来捕获感兴趣的区域，基于扩增的方法使用PCR来富集目标。

基于杂交的目标富集方法

在混合捕获方法中，该过程作为标准库准备工作流开始。DNA通过剪切或使用酶被分解。然后添加特定于测序平台的适配器。接下来，它们与生物素化寡核苷酸探针池一起孵育，这些探针旨在针对DNA片段库中感兴趣的特定区域。最后，利用链霉亲和素涂层磁珠吸引生物素化探针/目标杂交体。这种方法产生了一个高度富集目标DNA的测序库。

基于pcr的目标富集方法

在基于PCR的方法中，单PCR反应和多重PCR反应都可以使用。在多重PCR中，针对不同的靶基因使用多个引物在一次反应中产生多个扩增子。扩增后，进行归一化步骤，对多个PCR产物的浓度进行归一化。然后对集合的产物进行排序。虽然这种方法高效且易于使用，但由于多重反应试剂的成本，对于靶向大基因组区域并不理想。目标扩增失败和PCR偏误是与基于PCR的富集方法相关的其他缺点。