整个外显子组测序

专注于基因组的编码区域

整个外显子组测序（WES）提供了超过95％的外显子（基因组的表达或蛋白质编码区域）的覆盖率，这些外显子（表达或蛋白质编码区域）具有大多数大遗传变异和与人类相关的单核苷酸多态性（SNP）的大多数。疾病表型。¹在构成人类基因组的约30亿个碱基中，只有大约1％由编码序列表示。¹通过关注基因组中最相关的部分，WES为研究人员提供了更有效地使用测序和分析资源的能力。WES策略首先要缩小通过针对HAPMAP等数据库进行过滤的变体细节，从人类基因组项目中确定的大约350万个SNP。该重点为发现和验证致病基因以及常见和稀有变体的一种简单方法。事实证明，外显子组测序可用于鉴定稀有孟德尔疾病所涉及的突变。²

整个基因组测序（WGS）与整个外显子组测序

WGS和WES都有自己的优势。了解它们之间的主要差异可以帮助确定哪种方法最适合特定研究目的。

• WES仅覆盖基因组的表达区域，而WGS为两个外显子（表达序列）和内含子（中间序列）提供覆盖范围
• WES使用具有针对特定目标区域的探针的富集策略，而WGS使用参考基因​​组来对齐基因组的所有序列
• 由于需要对整个基因组进行测序，WES比WGS更具成本效益

为什么整个外显子组测序？

• 使外显子的全面覆盖能够针对医学相关的基因组区域，包括已知的疾病相关部位和未翻译区域（UTRS）
• 提高变异发现潜力，包括使用下一代测序（NGS）技术的罕见和低频突变
• 消除了对整个基因组进行测序的需求，为WGS提供了具有成本效益的替代方案

WES在多种情况下很有用：

• 如果因特定疾病（单基因）而闻名，则需要研究特定变体
• 在因果基因未知并且需要研究的情况下
• 如果怀疑多个基因参与特定疾病（多基因）

WES如何工作？

在文库制备过程中，基因组DNA被碎片，并使用溶液中的生物素化寡核苷酸探针捕获靶向区域。使用链霉亲和素珠分离捕获的靶序列，并在洗涤和洗脱步骤后用于随后的扩增和测序。

Roche测序解决方案提供了整个用于NGS样品制备的产品，从样本QC，目标富集到库定量，使能够制备高质量的DNA文库，对于获得高质量的整个外显子组测序数据至关重要。