KAPA HyperPETE工作流

概述

下一代测序(上天)样品制备需要许多步骤和每个步骤总体测序成功,效率是至关重要的,所有的步骤都需要优化的试剂和协议。考虑到门店的珍贵自然样品,一个集成的工作流与优化的试剂将样品转化为sequencing-ready库是必要的。上天可以不同的样本类型:

• 方便测序——统一或与二级结构或GC-rich地区
• 质量——新鲜提取或保存(福尔马林固定石蜡包埋- FFPE)
• 灵活的工作流- - - - - - DNA和RNA工作流应用程序进行了优化

考虑所有这些变化,重要的是使用图书馆准备试剂,可以有效地与所有这些样本类型。高质量的图书馆准备试剂帮助获得统一和改进的覆盖以及低重复率。根据最终的目标(例如,全外显子组测序),目标所需浓缩步骤也可以丰富感兴趣的特定区域。使用高效浓缩目标试剂有助于获得均匀的高特异性和高深度的报道(目标)在目标区域。

的KAPA HyperPETE工作流结合验证产品KAPA图书馆准备和KAPA目标浓缩。它提供了所有的配件和样品制备所需试剂,从DNA或RNA音序器单日工作流。新KAPA HyperPETE面板提供捕捉效率高,排序一致性优化较低和较高的变异检测的信心。此外,工作流将包括KAPA普遍(有或没有UMI -独特的分子指标)适配器和KAPA UDI混合底漆(384 *)。的KAPA HyperPETE工作流尤其适合小面板肿瘤学研究支持应用程序和一个集成的基于云的分析解决方案(NAVIFY^®突变调用者)。NAVIFY突变调用者支持KAPA HyperPETE工作流与管道进行体细胞SNV, Indel和CNV的召唤,微卫星不稳定性(MSI)得分,RNA融合检测(已知和未知融合伙伴)和生殖系SNV Indel调用。的KAPA HyperPETE工作流还提供了方便的简化命令和支持从一个供应商,并自动化友好。

* KAPA HyperPETE工作流与KAPA UDI验证引物混合1 - 96和理论上兼容KAPA UDI底漆和97 - 384

HyperPETE工作流的特点和优点

• 罗氏的知名设计专家允许变异检测困难的基因组区域
  

• 验证与挑战性的样本类型检测所有主要突变类(CNV, SNV Indels,融合包括未知的融合伙伴和MSI)

• 优化提供精确的分子数和低误码率使用KAPA普遍UMI适配器

• 杰出的混合捕获性能在小板通过广泛的工作流优化

• 单日工作流孵化项目和低hands-on-time较短

• 全包的工作流与验证产品和简化订购方便,支持从一个供应商