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转录组由不同群体的RNA分子组成,包括mRNA、rRNA、tRNA和其他非编码RNA(如microRNA、lncRNA)。使用下一代测序(NGS)技术的RNA测序(RNA- seq)使我们能够分析整个转录组,包括编码区和非编码区。它还有助于识别在不同细胞群中差异表达的基因,并提供有关其相对丰度的信息。此外,它使我们能够确定遗传变异剪接事件的影响,识别新的转录本,检测基因融合,异构体和其他结构变体,并调用单核苷酸变体(SNVs)。
为您的实验选择最佳RNA-Seq工作流程取决于许多因素,包括样本质量、输入量和感兴趣的转录本。目前支持的RNA-Seq工作流程可以分为三个主要类别:
整个转录组测序包括在给定时间测量样本中转录本的完整补体。通过对整个转录组的查询,研究人员能够确定每个转录本(编码和非编码)的整体表达水平,并识别外显子、内含子及其连接。
了解更多关于以下RNA-Seq应用:
mRNA转录本的测序为识别生物或实验条件之间表型差异的分子基础打开了大门。基因表达分析通过允许研究人员检测和量化多个编码转录本的表达水平,提供了超过基因组序列静态信息的有价值的见解。
ffpe衍生RNA的全转录组测序
罗氏RNA-Seq样品准备溶液
选择性转录本损耗
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