RNA序列

RNA测序可以进行转录组分析,复杂的基因表达分析和发现新的RNA物种

转录组由不同群体的RNA分子组成,包括mRNA、rRNA、tRNA和其他非编码RNA(如microRNA、lncRNA)。使用下一代测序(NGS)技术的RNA测序(RNA- seq)使我们能够分析整个转录组,包括编码区和非编码区。它还有助于识别在不同细胞群中差异表达的基因,并提供有关其相对丰度的信息。此外,它使我们能够确定遗传变异剪接事件的影响,识别新的转录本,检测基因融合,异构体和其他结构变体,并调用单核苷酸变体(SNVs)。

为什么要进行RNA测序?

  • 能够评估整个转录组的RNA表达水平、变异剪接事件、单核苷酸多态性(SNPs)和插入缺失(indels)事件
  • 通过不同的技术(靶向RNA测序,mRNA富集或rRNA缺失)灵活地评估特定的RNA群体
  • 通过靶向测序促进低丰度转录本和亚型的检测

支持RNA测序应用的工作流程

为您的实验选择最佳RNA-Seq工作流程取决于许多因素,包括样本质量、输入量和感兴趣的转录本。目前支持的RNA-Seq工作流程可以分为三个主要类别:

全转录组测序

整个转录组测序包括在给定时间测量样本中转录本的完整补体。通过对整个转录组的查询,研究人员能够确定每个转录本(编码和非编码)的整体表达水平,并识别外显子、内含子及其连接。

了解更多关于以下RNA-Seq应用:

信使rna捕获

mRNA转录本的测序为识别生物或实验条件之间表型差异的分子基础打开了大门。基因表达分析通过允许研究人员检测和量化多个编码转录本的表达水平,提供了超过基因组序列静态信息的有价值的见解。