细菌全基因组测序

解开微生物系统发育学之外的奥秘

利用下一代测序(NGS)技术对微生物进行全基因组测序(WGS),能够以前所未有的规模和分辨率对病原体进行识别、区分和监测;因此,深刻影响了诊断微生物学和公共卫生。1在第一个细菌基因组(流感嗜血杆菌1.8 Mb基因组)发表后的10年里,250个不同的细菌和11个古菌门在公开的数据库中被代表,微生物基因组总数超过30000。3.与使我们能够识别微生物并构建系统发育关系的16S rRNA测序不同,微生物WGS支持功能和比较研究,以及重要遗传变异的识别和表征。

微生物的常规WGS需要快速、健壮和可扩展的库构建工作流程,能够生成跨越广泛基因组大小、复杂性和基因组GC内容的高质量序列数据。罗氏公司样品准备的解决方案提供一种集成的样本准备方法,解决了将样本转换为可排序库所需的所有步骤。从样品采集到库量化,我们为不同的样品类型和测序应用提供样品准备解决方案证明简单的而且完整的

细菌WGS样品制备的挑战和解决方案

了解更多关于在低通量和高通量工作流程中生产高质量细菌WGS文库的挑战,以及如何应对这些挑战。罗氏灵活、流线化和完整的工作流程为各种基因组内容提供了高度和统一的覆盖范围,使原始样本的文库构建能够促进细菌基因组的从头组装。

  1. Motroa, Y等人。下一代测序在临床细菌学中的应用。Biomol Detect Quantif. 2017;14:1。doi: 10.1016 / j.bdq.2017.10.002
  2. 弗莱希曼,R.D.等人。流感嗜血杆菌全基因组随机测序和组装,科学,1995;269:496。doi: 10.1126 / science.7542800。
  3. 兰德,M.等。20年来的细菌基因组测序。功能。中国。基因组学,2015;15(2):141。doi: 10.1007 / s10142 - 015 - 0433 - 4。