全转录组测序

全转录组测序包括测量记录的完整补样品,在给定的时间。通过审讯的转录组,研究人员能够确定全球每个转录表达水平(包括编码和非编码)和识别外显子,内含子和它们的连接。全基因组分析微分RNA表达为研究人员提供了更大的见解生物通路和分子机制,调节细胞命运,开发和疾病进展。

方法和技术

图书馆总RNA制备需要最少的输入材料,使转录组的最全面的视图。然而,增加测序经济、改善覆盖low-abundance记录感兴趣的,不受欢迎的内容可以被移除之前图书馆建设或者所需内容后可以选择从总cDNA图书馆图书馆建设。由于RNA提取生物标本的质量可以高度可变,和数量限制,这些技术必须健壮、可靠和精简,以确保最高的输入转换成sequenceable材料。

RNA转录损耗

KAPA RNA与RiboErase HyperPrep包(HMR)或RiboErase (HMR)球蛋白提供选择性耗尽的记录(例如,rRNA,球蛋白mRNA和/或其他高度丰富的mRNA物种),其次是互补脱氧核糖核酸合成和图书馆建设。enzymatic-depletion化学是健壮的,兼容的高质量和退化的输入(如FFPE)从所有生物。

损耗工作流提供了一个完整的转录组,同时最小化浪费测序读从“无趣”的数量记录。

总RNA的输入,从变量样本质量,转化为互补脱氧核糖核酸分子库使用KAPA RNA HyperPrep包。这是紧随其后的是杂交捕获感兴趣的目标,只需要一小部分的阅读总RNA的深度测序。根据捕获面板的设计,这种方法只允许接受审讯的编码内容(例如,当使用一个外显子组小组),或者两者都和非编码区域。因为它不依赖于完整的3 '保利(A)反面,这个方法是兼容的RNA质量,和所有的生物。

仅供研究使用。不用于诊断程序。