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KAPA HyperCap目标富集探针自定义区域
杂交或基于捕获的目标富集使研究人员能够为下一代测序(NGS)富集特定的靶区。
凭借其著名的探针设计算法，罗氏推出了KAPA HyperCap目标富集自定义探针HyperDesign在线定制设计工具，用于更高的探测保真度和改进的目标捕获NGS。我们的KAPA HyperChoice和KAPA HyperExplore探针定制组合，以及我们的其他试剂和附件产品，帮助科学家提高他们的目标富集工作流程，节省测序成本。
用KAPA HyperCap靶富集自定义探针生成的测序数据可以用罗氏基于云的二级分析解决方案进行分析NAVIFY®突变调用者-用于准确检测变异。
KAPA超cap靶富集探针的特点和优点
KAPA HyperChoice和KAPA HyperExplore探头*:
- 通过更好的设计，使用罗氏著名的探针设计和选择算法，可以访问具有挑战性的基因组区域
- 无缝在线生成设计HyperDesign要么点击几下鼠标，要么通过专家设计师协助的过程
- 使用KAPA HiFi DNA聚合酶制造的高保真探针更强的富集
- 通过NGS的检测存在和浓度QC，质量和性能一致
- 高均匀性，低重复，优化少，测序效率高
- 简化二级数据分析与自信的种系SNV和Indel呼叫使用NAVIFY®突变调用者
*KAPA HyperExplore Probes为非人类基因组和非常规人类设计提供高达200 Mb的基因组区域富集。
产品亮点
表1:两种KAPA HyperChoice设计的性能
| 设计 | 基因 | 目标大小(捕获) | 总部读取 | 系统 | 总重复百分比 | 80折(均匀度) | %基数≥30X |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 神经退行性 | > 98 | 335 Kb | 1.75米 | NovaSeq 6000 | 2.78 | 1.38 | 99.83 |
| 遗传性疾病 | > 4100 | 12.3 Mb | 20.00米 | NovaSeq 6000 | 1.62 | 1.43 | 97.22 |
第一次迭代设计，在NovaSeq 6000系统上运行时，显示非常低的PCR重复，高均匀性(低Fold80碱基惩罚)和广泛的目标覆盖(碱基覆盖率≥30倍)。对于这两种设计，我们从100 ng NA12891 DNA开始遵循KAPA HyperCap工作流v3.0。指标是每个设计中单个捕获的6个重复的平均值。
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