1. 罗氏公司测序
  2. 目标浓缩
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  5. KAPA HyperExome探针
KAPA HyperExome

KAPA HyperExome

高效，均匀的基于杂交的全外显子组测序捕获

结合了十多年的探针设计经验和改进的探针制造工艺，新的KAPA HyperExome探针池实现了高效、均匀的基于杂交的全外显子组测序(WES)捕获。实现对基因组改变的敏感、可靠的检测，包括单核苷酸变异(SNVs)、索引、拷贝数变异(CNVs)、基因融合、倒置和外显子区域内的其他重排。

  • 通过优良的捕获均匀性降低测序成本和节省时间这降低了检测变异所需的测序量
  • 可靠地丰富具有挑战性的、以前难以到达的外显子区域
  • 确保准确的样品识别有387个样本跟踪snp
  • 简化目标排序使用我们的HyperCap Workflow v3，由KAPA HyperPrep或KAPA HyperPlus Library Prep Kits驱动

性能数据

降低测序成本，节省时间

  • 利用KAPA HyperExome的紧凑~43 Mb设计优化测序吞吐量
  • 与供应商X相比，实现更好的覆盖率，特别是更深入的测序

图1。与供应商X Exome相比，KAPA HyperExome的目标阅读率更高，中位数覆盖率更深，目标覆盖率更广。

最大的吞吐量与优越的捕获均匀性

  • 通过利用设计专业知识和使用广泛优化的面板来提高排序效率
  • 实现最佳的整体平衡，即使跨越难以捕获的区域

    图2。KAPA HyperExome实现了高度均匀的覆盖，甚至跨%GC高或低的区域。在用KAPA HyperExome探针捕获之前，使用KAPA通用适配器和KAPA UDI引物混合的KAPA HyperPlus试剂盒从100 ng DNA中制备文库。库(8)在捕获前复用，与探针杂交16小时，捕获后扩增，并在Illumina NovaSeq测序仪上测序(2 x 100 bp)。条形图表示来自16个不同细胞系的数据。面板B中的每个数据集都来自不同的细胞系。

    可靠地丰富具有挑战性的、以前难以到达的外显子区域

    • 提高ACMG59、CCDS、ClinVar等重要基因组数据库中关键研究基因的覆盖率
    • 发现更多的变种与全面而紧凑的KAPA HyperExome面板

    图3。与Supplier X Exome相比，KAPA HyperExome提供了更好的覆盖重要基因组数据库的功能。

    确保准确的样品识别

    研究人员经常使用控制峰值在整个NGS工作流程中跟踪样本。然而，样品处理错误仍然可能导致错误的样品识别。HyperExome针对387个选定的SNP位置，作为独立于样本处理的内在样本标识符，使研究人员能够:
    • 消除与手工添加样品跟踪峰值相关的错误
    • 增加NGS结果的可靠性，提高样本的可信度
    • 减少代价高昂的样本错误识别

      图4。KAPA HyperExome探针捕获的387个跟踪snp的样本跟踪概述。为了确认测序后的样品鉴定，首先使用独立的、正交的方法(如qPCR、SNP阵列、Sanger测序)建立每个样品的唯一身份，对~60 - 100个样品特异性SNP进行分类;选择与KAPA HyperExome面板捕获的snp相对应的snp是很重要的。然后通过匹配来自两个来源的SNP数据来确认样本身份。

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