芯片测序

确定全球DNA-associated蛋白质结合位点和表观遗传模式。

染色质免疫沉淀反应(芯片)结合高通量测序分析(ChIP-sequencing或ChIP-seq),是一种强大的技术识别全球DNA-associated蛋白的结合位点,以及表观遗传模式的变化。芯片是一种基于抗体的技术用于丰富交互的DNA分子直接与蛋白质,包括转录因子、replication-related蛋白质,和组蛋白。下游图书馆准备和测序可以让研究人员更好地了解转录因子和其他chromatin-associated调节基因的表达和表观遗传修饰的蛋白质。

为什么ChIP-seq ?

• 生成全基因组dna结合蛋白质和组蛋白修饰,以更好地理解转录和表观遗传基因调控,基因调控网络的功能和表观基因组地图
• 提供更大的覆盖范围、高分辨率、低噪音和较小的样品需求相比,基于数组的方法(ChIP-chip)

ChIP-seq是如何工作的呢?

ChIP-seq利用DNA和蛋白质之间的可逆交联的存在甲醛形成一个稳定的复杂。交联后,染色质是剪切和dna蛋白质复杂的使用抗体免疫沉淀反应的蛋白质。交联然后逆转和DNA测序。丰富的数量用于DNA测序分析在此方法中,往往是有限的,因此,建设高质量的图书馆从低投入的样品是至关重要的。

罗氏公司测序解决方案提供了一个完整的套件库的制备、扩增和定量工具为研究者提供增加收益率adapter-ligated图书馆的分子和减少放大的偏见。这最终会导致更多元化的图书馆,重复率低、均匀覆盖ChIP-seq等低投入的应用程序。