图2。与ARTIC扩增子方法相比，KAPA SARS-CoV-2面板可实现更均匀的覆盖。KAPA SARS-CoV-2 TE数据集的一个代表性复制(绿色)与带有v3引物的ARTIC工作流复制(灰色)的IGV覆盖图。在测试的所有3个重复中，在ARTIC文库的Spike基因中观察到近乎缺失的reads(黑箱)，而KAPA SARS-CoV-2 TE在整个Spike区域的覆盖更均匀。
仅供研究使用。不用于诊断程序。
使用KAPA SARS-CoV-2靶标富集面板监测SARS-CoV-2病毒序列和新变体的出现。从新鲜或降解的(如废水)样本中对病毒基因组进行测序，测序面板针对100%的参考SARS-CoV-2基因组(NC_045512)和另外183个公开可用的SARS-CoV-2基因组(GenBank)的99.7%。
图2。与ARTIC扩增子方法相比，KAPA SARS-CoV-2面板可实现更均匀的覆盖。KAPA SARS-CoV-2 TE数据集的一个代表性复制(绿色)与带有v3引物的ARTIC工作流复制(灰色)的IGV覆盖图。在测试的所有3个重复中，在ARTIC文库的Spike基因中观察到近乎缺失的reads(黑箱)，而KAPA SARS-CoV-2 TE在整个Spike区域的覆盖更均匀。
与16小时的杂交相比，将杂交时间缩短至1小时可获得相当于1倍的SARS-CoV-2基因组覆盖。从含有指定数量病毒拷贝的样本中生成的文库，在20 ng人类RNA的背景下与SARS-CoV-2靶标富集面板杂交1小时或16小时，并使用HyperCap Workflow v3进行处理，一式三份。一个。在1小时杂交时间和16小时杂交时间中，所有病毒拷贝水平的SARS-CoV-2基因组覆盖率均为1倍。B。具有较高病毒载量的样本在1小时和16小时杂交时间的20X下也产生了相似的基因组覆盖率，对于较低病毒载量的覆盖率略有降低。
图3。从含有指定数量病毒拷贝的样本中生成的文库，在20 ng人类RNA的背景下与SARS-CoV-2靶标富集面板杂交1小时或16小时，并使用HyperCap Workflow v3进行处理，一式三份。答:1小时杂交时间和16小时杂交时间对所有病毒拷贝水平产生了相似的1倍SARS-CoV-2基因组覆盖率。B.病毒载量高的样本在1小时和16小时杂交时间20倍时也产生了相似的基因组覆盖率，病毒载量低的样本的覆盖率略有降低。
图4所示。从含有指定数量病毒拷贝的样本中生成的文库，在20 ng人类RNA的背景下与SARS-CoV-2靶标富集面板杂交1小时或16小时，并使用HyperCap Workflow v3进行处理，一式三份。答:1小时杂交时间和16小时杂交时间对所有病毒拷贝水平产生了相似的1倍SARS-CoV-2基因组覆盖率。B.病毒载量高的样本在1小时和16小时杂交时间20倍时也产生了相似的基因组覆盖率，病毒载量低的样本的覆盖率略有降低。
KAPA SARS-CoV-2靶标富集面板可将97%的SARS-CoV-2基因组覆盖率从10个病毒拷贝降至1000个病毒拷贝和基因组序列。使用KAPA RNA HyperPrep和KAPA SARS-CoV-2 Target Enrichment Panel对含有指定数量的病毒拷贝的样本进行处理，背景为20 ng或100 ng的人类RNA背景。在分析之前，数据集将采样降至100万读。
图5。KAPA SARS-CoV-2靶标富集面板可将97%的SARS-CoV-2基因组覆盖率从10个病毒拷贝降至1000个病毒拷贝和基因组序列。使用KAPA RNA HyperPrep和KAPA SARS-CoV-2 Target Enrichment Panel对含有指定数量的病毒拷贝的样本进行处理，背景为20 ng或100 ng的人类RNA背景。在分析之前，数据集将采样降至100万读。
图6。KAPA SARS-CoV-2靶标富集小组在单个混合样本中确定了与6个变体相关的突变。来自6个不同变体的100万个SARS-CoV-2基因组拷贝与20 ng(深蓝色)或100 ng(黄色)的人类RNA结合，并使用KAPA RNA HyperPrep试剂盒和KAPA SARS-CoV-2靶标富集板进行三份处理，并进行标准16小时杂交。交替等位基因频率分析显示，来自6种SARS-CoV-2变体的所有预期突变都以接近预期频率的速度被识别出来。在分析之前，数据集将采样降至100万次读取。
| KAPA代码 |
罗氏的猫。没有 |
描述 |
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如何购买 |
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KAPA HyperCap SARS-CoV-2面板12 rxn |
12 rxn |
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KAPA HyperCap SARS-CoV-2面板48 rxn |
48 rxn |
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KAPA HyperCap SARS-CoV-2面板96 rxn |
96年rxn |
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