由于导致COVID-19的SARS-COV-2病毒已突变，因此越来越需要将病毒基因组从许多更多的covid-19-19阳性样品进行序列，以更好地了解该病毒及其传播。

人基因组包含约30亿个碱基对，其中约1-5％被翻译成功能蛋白。这些蛋白质中的突变最有可能导致直接的表型后果。尽管全基因组测序（WGS）提供了有关单核苷酸，结构或副本编号变体的丰富信息，但当时间或资源受到限制时，全外观测序（WES）通常更有意义。

由于通常只能收集一次基因组DNA样品，因此研究人员无法一次又一次地重复测序以获得良好的覆盖范围。例如，由于标本加工方案，福尔马林固定，石蜡包裹的组织（FFPE）组织通常是从癌症患者中收集的。

曾经依靠WGS获得可靠变体信息的研究人员现在正在转向WES的更快周转时间和成本效益。有大量证据表明，在临床研究环境中应用WES将导致诊断的改善，在某些情况下是遗传疾病的治疗。

测序指标，例如覆盖范围，目标率，GC偏置，折叠-80基本惩罚和重复率，提供了有关基于杂交NGS NGS目标富集实验的效率和特异性的重要信息。