KAPA hgDNA定量和质控试剂盒

概述

KAPA hgDNA定量和QC试剂盒包含在NGS文库建设之前,基于qpcr的人类基因组DNA样本定量和质量评估所需的所有消耗品。每个包包含KAPA SYBR快qPCR主混合,优化高性能SYBR绿色i基qPCR通过我们的定向进化技术这是一套预先稀释的DNA标准物和引物预混物,针对高度保守的单拷贝人类基因座的不同部分。绝对定量是通过引物对定义最短的片段和附加引物提供关于DNA样本中可扩增模板数量的信息来实现的。用该试剂盒生成的质量分数(或q -ratio)可用于预测文库建设的结果或为不同质量的样本定制工作流程,特别是FFPE DNA。

KAPA hgDNA定量和QC试剂盒的好处

  • 单次测定定量和质量评价
  • 能够将质量评分与排序指标相关联
  • 一个通用的、易于自动化的工作流

hgDNA定量和质控分析的原理

首先,使用三种不同的引物对,在一个保守的单拷贝人类位点中扩增41 bp、129 bp或305 bp的目标,使用一套DNA标准集生成最多三条标准曲线。接下来,41 bp法用于DNA样本的绝对定量。为了评估DNA质量,生成标准曲线,并使用129 bp和/或305 bp引物预混料(es)对样品进行分析。由于较差的DNA质量对较长的靶标扩增有较大的影响,可以通过将129 bp或305 bp测定法得到的浓度与41 bp测定法得到的浓度归一化来推断DNA样本的相对质量。这种归一化产生了一个q比(值在0到1之间),它表示DNA质量,或DNA样本中可扩增物质的数量。

产品亮点

通过单一试验获得浓度和质量信息

  • 允许绝对定量稀释的DNA样本
  • 用另一对引物进行定量,可以得到反映样品质量的q比

建立样本控制最小值

  • 说明样品的数量和质量是否足以成功制备文库
  • 通过消除库的构建和未通过QC的样品排序,减少时间和精力

为样品制备获得可操作的数据

  • q -ratio与关键的测序指标相关,如重复率和平均目标覆盖率