原始未知阶段-1920

使未知的为人所知

基因组分析如何在理解的癌症类型较差的癌症上脱落

皮埃尔·瓦莱特,艾美奖和皮博迪奖获奖记者和电视制片人
摄影师:加布Souza
2018年11月15日发布(2019年9月)

坦尼娅·诺特(Tanya Knott)说:“我们非常恐慌,因为肿瘤学家不知道那是什么。”她的妹妹萨拉(Sarah)患有一种罕见的疾病,被称为原发性不明癌症(简称CUP)。

坦尼娅解释说:“从一个可能的诊断到另一个可能的诊断,就像坐过山车一样,从子宫癌,到淋巴瘤,到生殖细胞,然后又回到淋巴瘤。”事实上,直到萨拉2015年31岁去世的那天,她的肿瘤学家们都不知道她得了哪种癌症。

杯子占所有癌症诊断的3%到5%。1令人沮丧的是,它的定义特征是没有真正的定义特征:患者表现为转移性癌症,但具体的起源位置未知。当医生使用传统的方法来治疗癌症时——即疾病和治疗是由起始部位来决定的——他们常常会对治疗方案不知所措。事实上,CUP最常见的治疗是六轮铂基化疗,通常无效,导致中位总生存率少于一年。了解更多关于CUP的信息下载我们的指南

作为一名神经外科医生,罗氏(Roche)的个人保健国际医疗总监安德里亚斯·贝林格(Andreas Beringer)博士亲身体验了杯子诊断对患者来说有多么困难。他说:“真的很难看到他们遭受了怎样的痛苦,他们怎么这么快就去世了,却没有意识到这个诊断对他们或他们的家人意味着什么。”

这真的会对你的内在力量产生负面影响,因为你是完全失明的,”罗氏(Roche)个性化保健国际医疗总监安德里亚·贝林格(Andreas Beringer)博士说

寻找遗传线索

贝林格博士说,这种疾病对医生来说也具有挑战性。“对于一个医生来说,杯子意味着你看不见你的敌人,”他说。“这真的会对你的内在力量产生负面影响,因为你完全失明了。你不知道该打谁,怎么打。”

在贝林格博士经历与杯状血球有关的“失明”的同时,波士顿基础医学公司(Foundation Medicine Incorporated)的医学主任杰夫·罗斯(Jeff Ross)博士试图阐明这种令人沮丧的不可知疾病。他觉得这样做是有权力的,因为有一种独特的癌症诊断方法。

2010年,基础医学,一种癌症基因组学初创,罗斯博士联合成立并现在拥有罗氏,开创了该领域中最先进的下一代测序(NGS)方法之一。基础医学使用精确的DNA采样和复杂算法的组合来为每个患者的癌症提供全面的基因组曲线。使用这种遗传概况,基础医学的临床研究团队剔除世界上最新的癌症文献,将每个患者的遗传概况与最着名的治疗方法或临床试验相匹配。迄今为止,基金会医学已突突超过30,000名患者,并根据其改进的结果出版了超过400篇论文。

有关综合基因组分析和基础医学的更多信息,请访问Roche-Foundation医学网站

杰夫·罗斯博士(Dr. Jeff Ross)是基础医学(Foundation Medicine)的医学主任和联合创始人,他领导了关于不明原发癌症背后的基因驱动因素的开创性研究。
杰夫·罗斯博士(Dr. Jeff Ross)是基础医学(Foundation Medicine)的医学主任和联合创始人,他领导了关于不明原发癌症背后的基因驱动因素的开创性研究。

2012年,正如基金会药物开始产生关于癌症患者的大量遗传数据一样,罗斯博士意识到他们中有多少人随着杯子诊断而进入。“很快,我已经组装了200杯案例,”他说。“我一定的是没有人知道他们的主要网站,并且没有进行测试,可以证明他们的主要网站在哪里。”从本质上讲,这些患者中的每一个都像Sarah Knott一样。

罗斯博士说:“在我们做出遗传分析后,我感到震惊,以发现可能的目标基因突变的宝库,”罗斯博士说。从本质上讲,罗斯博士注意到关于潜在治疗的疾病的特定遗传线索 - 这疏忽了大多数肿瘤学家的东西。

我震惊地发现了可能的目标基因突变的宝库,”基金会医学主任杰夫·罗斯博士说

改变生活的报告

这一发现的意义深远。罗斯博士回忆道,当他把他的发现提交给美国医学协会杂志,编辑对“他们不想在Jama发布它;他们希望将其用作新杂志的首页文章,JAMA肿瘤学”。

本文罗斯博士表示,展示了在杯子患者上使用的类似测试,可以“找到许多不同的途径,以便如何治疗可能最终的患者,并且比传统的化疗方法更长的存活率。”

在这篇文章发表后不久,基础医学开始对那些基因检测发现有已知治疗方法的杯子患者提出治疗建议。其中一位病人是希瑟,一位来自马里兰州的60岁妇女。2013年,希瑟的医生在她的大脑中发现了一个恶性肿瘤,被诊断为CUP。

“如果按照标准的化疗治疗,她可能会在不到一年的时间里死去,”罗斯医生说。但是基础医学测试揭示了一种基因改变,对此有一种有效的治疗方法。

迄今为止,基金会医学已突突超过30,000名患者,并根据其改进的结果出版了超过400篇论文。
迄今为止,基金会医学已突突超过30,000名患者,并根据其改进的结果出版了超过400篇论文。

收到基础医学报告是改变我一生的时刻,希瑟回忆道:“在经历了所有的化疗和仍然生病之后,我的医生告诉我,他们发现了一些可能对我的病情有帮助的东西。突然之间,新的希望出现了。”她的医生立即开始了新确定的治疗。四年后,希瑟讲述了她的经历:“肿瘤缩小了,副作用可以忽略不计,我又开始享受生活,可以周游世界了。”

希瑟和其他十几个病例虽然只是轶事,却给罗斯博士和他的同事们带来了希望和动力。“这是我们完全没有得到满足的医疗需求。如果我们能让20%到30%的患者接受靶向治疗或免疫治疗,帮助延长他们的寿命,那就是一个重大突破。”

在2015年建立基础医学和罗氏在杰夫罗斯·德国癌症研究中心的肿瘤科学家阿尔金·凯尔博士的初始工作中加入了武器建立的武器建立的雄心的机会。

利用其全球资源,解决复杂疾病的经验,以及罗氏的有效治疗的广泛的武库,能够帮助基础医学发展多场国际研究,该研究将测试杯子患者的分子指导治疗的疗效和安全性。

多目标的试验

在过去的一年里,该研究团队完成了对4500多名患者的全面基因分析,确定了9种最常见的基因改变,目前已经有针对性和有效的治疗方法。这些基因组改变和相关治疗确定了该试验的九个治疗分支。为了帮助确定每个患者最合适的治疗方案,研究小组制作了一个杯子分子肿瘤板——这是第一个由病理学家、杯子专家和患者的治疗肿瘤医生组成的小组。

他们称之为试验Cupisco,在拉丁语中意味着“愿望”。试验的第一个网站于2018年4月推出,并在2022年完成其最终报告之前最终在四大大陆招收790名患者。为了成功,需要表明,对于统计大量的患者,每个治疗臂的结果改善。

基础医学使用世界上最先进的机器,在复杂算法的指导下,为每个患者生成癌症基因组轮廓。
基础医学使用世界上最先进的机器,在复杂算法的指导下,为每个患者生成癌症基因组轮廓。

来自巴黎的肿瘤学家朱利亚·巴齐亚雷罗博士(Giulia Baciarello)的医院是试验地点之一,她希望这项试验能引导医生采用治疗肺癌的方法:针对不同的基因改变采用多种有针对性的治疗方法,而不是一刀切的解决方案。

“这将使我们能够为每位患者提供个性化的待遇,以改善整体生存,”Baciarello博士说,“并减少患者和治疗医生经历的心理创伤。”

尽管CUPISCO试验将需要4年多的时间才能完成,但它已经对患者和肿瘤学家带来了重大的希望。

制作杯子个人

塔尼娅·诺特(Tanya Knott)是杯式咖啡患者的倡导者,她的妹妹萨拉(Sarah)于2015年死于这种疾病。诺特称,CUPISCO试验是“对杯式咖啡患者来说最令人兴奋的进展”。她说,这项试验将提供“我们从未有过的针对患者的具体信息,减轻了我们不得不经历的许多挫折。”

罗斯博士说,由于试验的地理范围,这种靶向治疗将惠及更广泛的患者。他说:“与罗氏的合作意味着,欧洲、甚至是更小的发展中国家的更多患者可能获得最前沿的药物,如果没有这次试验,他们将无法获得这些药物。”

医生也将从该过程中受益,Baciarello博士说,指向杯子分子肿瘤委员会作为即时,有形的益处。“这么少的肿瘤科医生对杯子或如何治疗它有任何熟悉,”她说。“而不是呕吐他们的手,他们现在可以访问专家和精确的分子信息,这将有助于他们管理疾病,并与患者清楚地沟通。”

库斯科的试验是对杯型咖啡患者最令人兴奋的进展。
基础医学的临床研究团队将患者的基因图谱与最知名的治疗方案或临床试验进行匹配。
基础医学的临床研究团队将患者的基因图谱与最知名的治疗方案或临床试验进行匹配。

的确,坦尼娅·诺特(Tanya Knott)相信肿瘤委员会将消除她所谓的“多学科团队网球”:她姐姐曾有过的那种“你从一个团队到另一个团队,再回到另一个团队”的经历。你不属于任何地方。你在中间的位置。你已经被夹在中间了。”

罗斯博士也有同样的希望,CUPISCO的试验将是让CUP走出阴影的重要一步。

“杯子病人被当作贱民对待,”罗斯博士说。他说:“当人们死得如此之快时,很难有任何公众意识,也很难得到社会的支持。”“如果我们能够做出哪怕是很小的增量改变,你就会开始有以寿命较长的患者为首的支持社会,帮助为新诊断的患者提供支持。”

罗斯博士和贝林格博士认为,除了杯状肿瘤的具体特点,这项研究还可以作为一种更个性化的治疗方法的模型,在这种方法中,根据每位患者肿瘤的独特分子构成来确定或发现特定的治疗方法。

“每种肿瘤都有如此多的信息,使其治愈的关键是我们可能缺失的关键。通过其本质,杯子要求我们整合我们对患者癌症遗传学的一切,因为这是我们唯一要继续的事情。通过这种方式,它是真正个性化医学的原型,“Beringer博士说。

罗斯博士同意:“Cupisco审判有机会改变。”

参考文献

  1. Stella G.M.等(2012)J Transl Med 10:12;2.Urban, D.等(2013)Br J Cancer 109:1318-24

标签:个性化医疗