用罗氏测定法检测冠状病毒变异

导致COVID-19的病毒变体继续成为新闻。以下是关于我们的测试需要了解的内容。

2022年7月15日

从delta到omicron再到导致COVID-19的下一种病毒变体,罗氏诊断公司定期调查SARS-CoV-2突变的影响。随着新的变异菌株的出现,我们致力于确保我们的测试按预期执行。

我们继续监测SARS-CoV-2变种的演变,并继续致力于为实验室提供高质量的分子和血清学检测解决方案,以帮助诊断受影响的患者。

根据我们的测定方法设计和我们全球监测团队的计算机分析,我们预计不会对罗氏SARS-CoV-2测定方法的性能产生影响。这包括:

  • cobas®SARS-CoV-2和cobas®SARS-CoV-2和A/B流感使用cobas®6800/8800系统
  • cobasSARS-CoV-2和cobasSARS-CoV-2和A/B流感使用cobas®Liat系统
  • GenMarkDx®ePlex呼吸道病原体面板(RP2面板)

我们有很大的信心,我们最初的分子测试设计,包括两个专注于病毒不倾向于变化的区域的目标,仍然适用于目前识别的所有变体。

截至2022年5月15日的公共利益变体(包括Omicron BA.4和BA.5)

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截至2022年5月15日的公共利益变体(包括Omicron BA.4和BA.5)

世界卫生组织(世卫组织)标记*
最先发现的国家
Pango血统
Nextsrain进化枝
cobas®SARS CoV-2用于cobas®5800/6800/8800系统
cobas®SARS CoV-2和流感A/B测试用于cobas®5800/6800/880系统
cobas®SARS CoV-2和流感A/B测试用于cobas®Liat®系统
cobas®SARS CoV-2测试用于cobas®Liat®系统
α
英国 B.1.1.7 20我 检测到 检测到 检测到 检测到
β 南非 B.1.351 20 h 检测到 检测到 检测到 检测到
γ

日本和巴西

第1页 20 j 检测到 检测到 检测到 检测到
δ ndia B.1.617.2 21日,I, J 检测到 检测到 检测到 检测到
埃塔 非洲 B.1.525 21 d 检测到 检测到 检测到 检测到
极微小 美国 B.1.526 21 f 检测到 检测到 检测到 检测到
λ 秘鲁 C.37 21克 检测到 检测到 检测到 检测到
μ 哥伦比亚 B.1.621 21小时 检测到 检测到 检测到 检测到
欧米克隆(BA.1 - BA.5)

南非

B.1.1.529

21日k, L, M

22a b c

检测到 检测到 检测到 检测到

*这些变体的序列沉积在GISAID过去一周的数据库。它们反映了循环中的序列。为了清晰起见,已删除了流通中的菌株。所有的变异都已通过计算机分析进行评估,并预测所有的分子测试都能检测到它们。

术语“deltacron”和“deltamicron”用于指x - omicron重组体。世界卫生组织于2022年3月9日正式承认了这些混血儿的存在。delta和omicron之间以及omicron亚谱系BA.1和BA.2内的重组事件发生在不同的断点。已确认的重组体命名为x字母(XA-XS)。一些报告显示BA.1 x BA.2重组病毒增加,并将其命名为XE的穿山甲命名法。值得注意的是,这种变异尚未升级为英国、美国、欧洲疾病预防控制中心(ECDC)或世卫组织关注的变种。XE的断点在nsp3,具有BA.2的spike基因。其他重组也在循环中,但这个是最丰富的。XD和XF是x欧米隆变体。XD和XF的案例编号低于XE。

这些重组不会影响我们的检测目标,我们也没有发现任何检测问题。我们的监测团队将继续密切关注这一情况,以了解任何新的断点在哪里,以及任何重组菌株是否有可能对我们的分析产生影响。

罗氏分析了已发表的SARS-CoV-2变种的序列,并将变种特异性突变与以下免疫测定法的设计进行了比较:

  • Elecsys®Anti-SARS-CoV-2化验
  • Elecsys®抗sars - cov -2 S检测

血清学抗体检测运行在Elecsys®e分析仪

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血清学抗体检测运行在Elecsys®e分析仪

世界卫生组织(世卫组织)标记*
最先发现的国家
Elecsys抗sars - cov -2检测
Elecsys抗sars - cov -2 S检测
α 英国 没有受到影响 没有受到影响
β 南非 没有受到影响 没有受到影响
γ

日本和巴西

没有受到影响 没有受到影响
δ ndia 没有受到影响 没有受到影响
埃塔 非洲 没有受到影响 没有受到影响
极微小 美国 没有受到影响 没有受到影响
λ 秘鲁 没有受到影响 没有受到影响
μ 哥伦比亚 没有受到影响 没有受到影响
ο

南非

没有受到影响 在调查中* *

**目前,罗氏无法估计Elecsys Anti-SARS-CoV-2 S检测对SARS-CoV-2 omicron变体的表现。一旦有关omicron变体对检测性能影响的实验证据产生,这些结果将被共享。

有关变异的更多见解以及罗氏如何警惕地监测以保护患者,请阅读这篇文章我们的两位医学诊断专家

这个故事可能会更新。如果您对我们的测试性能有其他问题,请联系罗氏诊断公司的医疗和科学事务团队,网址(电子邮件保护)