KAPA探针力qPCR试剂盒

仅供研究用途。不用于诊断程序。

KAPA qPCR

概述

KAPA PROBE FORCE qPCR试剂盒含有高抗抑制剂的qPCR主混合物,无需DNA纯化,实现了简化的样品到cq的工作流程。通过我们的定向进化技术工程的第三代DNA聚合酶对血液、组织和植物PCR抑制剂具有耐药性。这使得粗样品的分析具有与纯化DNA相当的准确性、可重复性和敏感性。

KAPA PROBE FORCE qPCR试剂盒的好处
  • 直接qPCR从粗血,组织和植物提取物
  • 1小时内完成样品到cq的工作流程
  • 高效,结果准确,重现,灵敏
  • 对残留抑制剂具有优良的耐受性
  • 与粗提物多重配伍

产品亮点

生成准确和可重复的结果
  • 在有PCR抑制剂的情况下,反应效率高,数据生成可靠

使用KAPA PROBE FORCE qPCR试剂盒查看显示与各种困难样品的高反应效率的数据。

突破高水平的qPCR抑制剂
  • 与其他可用试剂盒相比,对受抑制的血液、组织和植物样本具有更高水平的敏感性*
  • 转换纯化的DNA化验到粗糙的工作流程,没有观察到Cq延迟

使用KAPA PROBE FORCE qPCR试剂盒查看显示广泛的抑制剂耐药性和一致的无Cq延迟扩增的数据。

有效地多取原油样品
  • 利用DNA粗提取物单反应等位基因鉴别加速基因分型分析
  • 通过多路复用,最大化珍贵样本的数据收集,提高吞吐量,降低成本

使用KAPA PROBE FORCE qPCR试剂盒从各种粗样品中查看显示高效基因分型和SNP检测的数据。

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*数据文件。

规范

  • 兼容的平台

    所有实时qPCR系统不考虑ROX被动对照染料的要求

  • 起始物料

    粗血,组织,植物DNA提取,纯化gDNA, cDNA

  • 输入数量

    最高可达200ng

  • 可用的设备尺寸

    1毫升,5毫升,10毫升,50毫升

试剂盒可在-20℃下保存12个月。主混合物包括KAPA3G HotStart DNA聚合酶,dNTPs(包括dUTP), MgCl2, ROX参考染料和稳定剂。

组件

组件
统一用预混料(火箭)
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设备代码 罗氏的猫。没有 描述 包大小
KK4300 07959320001 KAPA PROBE FORCE qPCR试剂盒- 100 x 20 μ L反应(通用) 1毫升
KK4301 07959338001 KAPA PROBE FORCE qPCR试剂盒- 500 x 20 μ L反应(通用) 5毫升
KK4302 07959346001 KAPA探针力qPCR试剂盒- 1000 x 20 μ L反应(通用) 10毫升
KK4303 07959354001 KAPA探针力qPCR试剂盒- 5000 x 20 μ L反应(通用) 50毫升
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KAPA探针力的推荐应用是什么?

  • 具有挑战性的样本类型分析:从血液、组织、植物材料和环境样本中提取粗DNA, cDNA模板/从cDNA合成反应中直接携带)
  • 基因分型(转基因检测,小鼠转基因,SNP分析/等位基因鉴别)
  • 基因表达分析(病原检测、传染病研究、癌症研究)
  • 多路复用的应用程序

KAPA探针力中的酶是什么?

该产品包含第三代DNA聚合酶,进化以克服PCR抑制剂的影响。这种DNA聚合酶也可以实现非常快速的反应协议。该酶与一种专有抗体结合,使酶在第一个变性步骤前失活,消除了在反应建立和启动过程中由非特异性启动事件产生的假扩增产物,并提高了整体反应效率。

哪些探针化学物质与KAPA探针力兼容?

KAPA PROBE FORCE qPCR Master Mix与所有基于探针的化学试剂兼容,包括水解和杂交探针。

在我的qPCR反应中,引物/探针的浓度应该是多少?

引物和探针的最终浓度一般为0.1µM - 0.5µM。建议您从0.2 μ M的初始最终浓度开始。使用最低浓度仍能产生最佳PCR效率。

对有问题的分析有什么优化建议吗?

引物和探针设计

  • 标准分析通常设计F & R引物Tm值在~60℃,探针Tm值在~67℃- 70℃,标准PCR退火/延伸温度为60℃。根据感兴趣的序列,这种“标准”设计和PCR方法可能并不总是能提供最佳性能;而且,甚至可能不容易设计出符合这些标准参数的分析方法。困难的分析往往是那些目标序列位于高gc区。对于大多数检测,在98°C持续3分钟的标准初始变性将有效地变性DNA模板的高gc区域,但在某些情况下,可能还需要将退火/延伸温度提高到正常60°C以上,因为扩增子本身在60°C下可能有太多的二级结构,无法有效扩增和/或探针结合。在少数极端情况下,根据PCR产物的特性,如果循环变性也在98°C(10秒)进行,可能会获得更好的结果。


规模的扩增子

  • 通常,基于探针的qPCR扩增子的长度在200 bp以下。对于更长的PCR产物,退火/延伸时间可能必须优化,以获得最佳的PCR效率。


探针浓度

  • 如果在SNP检测中出现低信号,将探针浓度增加到0.4或0.8 μ M可能会有帮助。只要保持特异性,退火/延伸温度也可以在标准60°C的基础上降低几度。


仪器变化

  • 在分析优化过程中值得记住的是,所谓相同的热循环试剂往往显示出显著不同的性能特征,在某些情况下,这可能需要针对单个循环试剂优化PCR协议。

在使用探针时,什么会导致高背景荧光水平?

如果探针被降解,荧光团与淬灭器分离,导致背景荧光增加。当稀释探针或引物和建立反应时,只能使用无菌缓冲液、水和实验室塑料。

KAPA探针力qPCR主混合剂是否含有参考染料?

是的。KAPA PROBE FORCE qPCR Master Mix含有低浓度的ROX,可与多种实时热循环器兼容。

什么时候我需要在我的qPCR反应中添加额外的氯化镁?

KAPA PROBE FORCE qPCR Master Mix中含有最终浓度为4.5 mM的氯化镁,这足以进行绝大多数反应。通常不需要额外的镁,除非已知反应模板含有显著浓度的镁螯合化合物(如EDTA),并且在反应中使用高浓度的镁。

多重检测的推荐反应条件是什么?

从标准建议引物/探针浓度(0.2 μ M)和反应方案开始。只要引物和探针的设计使检测之间的干扰最小,结果应该是令人满意的。包括多个无模板控制反应,以确保引物和探针本身在没有模板的情况下不会引起假信号。由于复配反应中引物的总浓度是标准反应的几倍,所以发生非特异性相互作用的可能性要高得多。这可以通过使用最低的引物/探针浓度和最短的退火/延伸时间来解决,但仍然可以获得最佳的PCR效率。减少PCR反应体积也减少了非特异性相互作用的可能性。

从哪里开始优化粗样品或粗提取物作为PCR模板?

  • 当以粗样或粗提物为模板时,一般规律是首先优化反应中粗样的大小或粗提物的体积。将一系列粗样本量或粗提取物体积/稀释度增加到一个不相关的测试qPCR中(例如,将粗植物提取物放入以小鼠DNA为模板的qPCR中),以确定在什么点开始发生不可接受的PCR抑制。理想情况下,最佳粗样本量或粗提取量应该不会对测试qPCR产生显著抑制作用,同时仍能提供足够的模板DNA,以便在以粗样本本身的DNA为目标的检测中进行可靠的扩增。
  • 一些粗样品,如鼠尾提取物,引起非常低或没有PCR抑制,非常容易纳入粗样品工作流程。其他的,如粗植物提取物,通常会产生更大的抑制作用,需要更仔细地优化。

KAPA探针力每次反应能耐受多少肝素血或肝素?

KAPA PROBE FORCE在20µl的反应中可以耐受高达10 ng的肝素(0.0021 IU),且无显著抑制作用。每20 μ l反应使用0.5 μ l 10倍稀释的肝素血作为起始点。

每次反应建议使用多少EDTA血与KAPA探针力?

在20µl的反应中使用1µl的10倍稀释剂。

为什么推荐的初始变性时间这么长(3 - 10分钟)?

抗体介导的KAPA 3G DNA聚合酶热启动在98°C下20秒后完全失活,但复杂模板的最佳变性可能需要长达3分钟或更长时间。有些类型的粗样品,如植物叶盘或种子碎片,可能需要10分钟的最佳结果。

我可以使用标准循环协议而不是快速循环协议吗?

KAPA PROBE FORCE在推荐的快速循环协议上表现最好,但在标准(慢)协议上也会得到很好的结果。

什么可以导致无模板控件(ntc)产生积极的结果?

主混合物、引物原液、水或PCR设置环境可能被DNA模板或前一次PCR扩增的PCR产物污染。设计和/或合成不当的引物和探针也有可能导致“假阳性”结果;降解的引物和探针也可能导致同样的结果。应遵循良好的实验室规范,以避免DNA模板污染。

KAPA PROBE FORCE qPCR混合蛋白的储存建议是什么?

KAPA PROBE FORCE qPCR Master Mix应在-20°C下长期保存(从收到试剂盒起最长可保存12个月)。对于短期的短期储存,更方便的方法是在4°C下储存3个月。永远保护套件避光,因为它含有ROX参考染料。

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